ABSTRACT
BACKGROUND Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infections in domestic animals have occurred from the beginning of the pandemic to the present time. Therefore, from the perspective of One Health, investigating this topic is of global scientific and public interest. OBJECTIVES The present study aimed to determine the presence of SARS-CoV-2 in domestic animals whose owners had coronavirus disease 2019 (COVID-19). METHODS Nasopharyngeal and faecal samples were collected in Uruguay. Using quantitative polymerase chain reaction (qPCR), we analysed the presence of the SARS-CoV-2 genome. Complete genomes were obtained using ARTIC enrichment and Illumina sequencing. Sera samples were used for virus neutralisation assays. FINDINGS SARS-CoV-2 was detected in an asymptomatic dog and a cat. Viral genomes were identical and belonged to the P.6 Uruguayan SARS-CoV-2 lineage. Only antiserum from the infected cat contained neutralising antibodies against the ancestral SARS-CoV-2 strain and showed cross-reactivity against the Delta but not against the B.A.1 Omicron variant. MAIN CONCLUSIONS Domestic animals and the human SARS-CoV-2 P.6 variant comparison evidence a close relationship and gene flow between them. Different SARS-CoV-2 lineages infect dogs and cats, and no specific variants are adapted to domestic animals. This first record of SARS-CoV-2 in domestic animals from Uruguay supports regular surveillance of animals close to human hosts.
ABSTRACT
Introducción: en nuestro país no existen trabajos sistemáticos relativos a la incidencia de virus que provoquen encefalitis y meningitis. Sí existen trabajos realizados en las décadas de1960 y 1970 sobre seroprevalencia de arbovirus y poliovirus. Mediante la técnica de reacción en cadena de polimerasa (PCR) aplicada al líquidocefalorraquídeo (LCR) hoy es posible realizar en un breve lapso de tiempo un diagnóstico de certeza sobre diversos agentes virales responsables de estas neurovirosis. Material y métodos: se exploró la incidencia de virus de la familia herpes, enterovirus y grupoarbovirus mediante técnicas de PCR aplicadas al LCR en pacientes VIH negativos. Resultados: este trabajo presenta a 59 pacientes VIH negativos que padecieron encefalitis ymeningitis de presumible etiología viral. Estos agentes son los responsables de la mayor cantidad de meningitis y encefalitis que suceden en nuestro continente. Conclusiones: el diagnóstico virológico final es posible realizarlo en más de la mitad de los casos presentados, predominando virus de la familia herpes tanto en niños como en adultos, no siendo despreciable la incidencia de enterovirus. No se detectó en este trabajo la presencia de arbovirus.
Introduction: in our country there are no systematic studies on the incidence of virus as a cause of encephalitis and meningitis. However, some studies on the seroprevalence of arbovirus and poliovirus were carried out in the sixties and seventies. Today, the polymerasechain reaction (PCR) applied to cerebrospinal fluid technique allows us to obtain accurate diagnosis within a short time, on the different viral agents that cause these neuroviroses.Method: we explored the incidence of virus from the herpesvirus, enterovirus and arbovirus group through PCRtechniques applied to HIV negative patients. Results: this study included 59 HIV negative patients who suffered from encephalitis and meningitis of viral etiology. These agents are responsible for most of the cases of meningitis and encephalitis in our continent.Conclusions: the final viral diagnosis may be obtained in over half of the cases presented. The herpesvirus is themost frequent both in children and in adults, being it significant the incidence of enterovirus. No arbovirus wereidentified in this study.
Introdução: no nosso país não existem estudos sistemáticos relativos à incidência de vírus que provoquemencefalites e meningites. Existem trabalhos realizados nas décadas de 1960 e 1970 sobre a soroprevalência dearbovírus e de poliovirus. Utilizando a técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) no líquido cefalorraquidiano (LCR) é possível realizar, em pouco tempo, um diagnóstico de certeza sobre diversosagentes virais responsáveis por estas neuroviroses. Material e métodos: buscou-se determinar a incidênciade vírus das famílias herpes, enterovírus e grupo arbovírus pelas técnicas de PCR no LCR de pacientes VIH negativos.Resultados: este trabalho apresenta 59 pacientes VIH negativos que tiveram encefalite ou meningite com provável etiologia viral. Estes agentes são responsáveis pelo maior número de casos de meningite e encefalite nonosso continente. Conclusões: em mais da metade dos casos apresentadosfoi possível realizar o diagnóstico virológico final; registrou-se uma predominância dos vírus da família herpes tanto em crianças como em adultos sendo que a incidência de enterovírus não era desprezível. Não se detectou a presença de arbovirus.
Subject(s)
Encephalitis, Viral/diagnosis , Meningitis, Viral/diagnosis , Polymerase Chain ReactionABSTRACT
Los enterovirus son responsables de la mayoría de las meningitis virales agudas. Menos conocida es su incidencia en otras entidades neurológicos que afectan el sistema nervioso central (SNC). Se presentan dos casos clínicos, el primero corresponde a la encefalitis de curso agudo en un pacinete oncológico y el restante a una mielitis transversa aguada, que ilustran lo mencionado. En ambos casos fueron fundamentales las técnicas de reacción de cadena de polimerasa (PCR) aplicadas al líquido cefalorraquideo (LCR) para arribar al diagnóstico etiológico. Se menciona al Pleconaril como agente antiviral de utilidad.